請求書や見積書の行数が多い場合、改ページをすることはできますか。

できます。
登録された情報量によって1ページに収まらない場合は自動で改ページされます。

各帳票の詳細「レイアウト」から表示サイズなどの一部変更が可能です。
メニュー【発行】より各種帳票の詳細ページを開いて「レイアウト」マークを選択し、ご希望の仕様を選択してください。